フェルディナンドは神聖ローマ皇帝フランツ2世の弟であり、イタリアのトスカーナ大公に封ぜられた。ナポレオン率いるフランス軍がトスカーナに侵攻するとその地位を追われ、その代償として1803年4月に新設されたザルツブルク選帝侯に封ぜられる。ザルツブルク選帝侯領ではオーストリアとは異なり、皇帝の代わりにフェルディナンドの肖像を刻んだコインが発行されたが、貨幣単位や価値は同じだった。

　住民の福祉を重んじたフェルディナンドの施政はおおむね好評だったが、ナポレオンの攻勢によって再び領地を追われ、ウィーンの宮廷に逃れた。1806年に神聖ローマ帝国が解体されると選帝侯の地位と称号は消滅し、ザルツブルクはオーストリア皇帝が統治する公国に再編された。